Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK4P11802 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK4P11802 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK4P11802 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK4P11802 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK4P11802 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK4P11802 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK4P11802 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK4P11802 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK4P11802 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK4P11802 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK4P11802 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK4P11802 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK4P11802 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK4P11802 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK4P11802 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK4P11802 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK4P11802 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK4P11802 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK4P11802 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK4P11802 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK4P11802 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK4P11802 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK4P11802 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK4P11802 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK4P11802 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK4P11802 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK4P11802 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK4P11802 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK4P11802 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK4P11802 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK4P11802 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK4P11802 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK4P11802 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK4P11802 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK4P11802 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK4P11802 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK4P11802 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK4P11802 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK4P11802 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK4P11802 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK4P11802 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK4P11802 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK4P11802 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK4P11802 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK4P11802 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK4P11802 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK4P11802 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK4P11802 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK4P11802 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK4P11802 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK4P11802 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK4P11802 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK4P11802 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK4P11802 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK4P11802 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK4P11802 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK4P11802 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK4P11802 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK4P11802 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK4P11802 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK4P11802 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK4P11802 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK4P11802 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK4P11802 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK4P11802 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK4P11802 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK4P11802 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK4P11802 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK4P11802 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK4P11802 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK4P11802 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK4P11802 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK4P11802 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK4P11802 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK4P11802 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK4P11802 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK4P11802 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK4P11802 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK4P11802 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK4P11802 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK4P11802 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK4P11802 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK4P11802 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK4P11802 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK4P11802 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK4P11802 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK4P11802 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK4P11802 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK4P11802 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK4P11802 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK4P11802 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK4P11802 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK4P11802 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK4P11802 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK4P11802 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK4P11802 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK4P11802 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK4P11802 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK4P11802 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms