Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAMP11215 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGAMP11215 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAMP11215 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms