Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD8BP10966 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD8BP10966 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD8BP10966 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8BP10966 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8BP10966 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD8BP10966 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD8BP10966 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD8BP10966 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8BP10966 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8BP10966 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8BP10966 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8BP10966 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8BP10966 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8BP10966 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8BP10966 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8BP10966 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8BP10966 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD8BP10966 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD8BP10966 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD8BP10966 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD8BP10966 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD8BP10966 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD8BP10966 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8BP10966 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8BP10966 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8BP10966 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8BP10966 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8BP10966 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8BP10966 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8BP10966 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8BP10966 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8BP10966 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8BP10966 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8BP10966 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8BP10966 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8BP10966 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8BP10966 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8BP10966 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8BP10966 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8BP10966 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8BP10966 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8BP10966 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8BP10966 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8BP10966 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8BP10966 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8BP10966 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD8BP10966 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD8BP10966 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD8BP10966 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD8BP10966 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD8BP10966 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD8BP10966 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8BP10966 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8BP10966 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8BP10966 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8BP10966 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8BP10966 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8BP10966 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8BP10966 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8BP10966 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8BP10966 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8BP10966 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8BP10966 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8BP10966 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD8BP10966 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD8BP10966 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD8BP10966 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD8BP10966 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD8BP10966 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8BP10966 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8BP10966 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8BP10966 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8BP10966 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8BP10966 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8BP10966 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8BP10966 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8BP10966 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8BP10966 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8BP10966 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8BP10966 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8BP10966 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8BP10966 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8BP10966 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8BP10966 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8BP10966 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8BP10966 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8BP10966 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8BP10966 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8BP10966 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8BP10966 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8BP10966 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8BP10966 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8BP10966 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD8BP10966 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD8BP10966 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD8BP10966 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD8BP10966 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD8BP10966 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD8BP10966 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms