Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IRF1P10914 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF1P10914 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF1P10914 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF1P10914 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF1P10914 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF1P10914 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRF1P10914 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRF1P10914 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRF1P10914 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRF1P10914 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRF1P10914 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRF1P10914 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRF1P10914 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRF1P10914 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRF1P10914 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRF1P10914 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IRF1P10914 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRF1P10914 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRF1P10914 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRF1P10914 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRF1P10914 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRF1P10914 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF1P10914 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF1P10914 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF1P10914 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF1P10914 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF1P10914 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF1P10914 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF1P10914 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF1P10914 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF1P10914 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF1P10914 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF1P10914 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF1P10914 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF1P10914 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF1P10914 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF1P10914 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF1P10914 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF1P10914 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF1P10914 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF1P10914 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF1P10914 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF1P10914 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF1P10914 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF1P10914 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF1P10914 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF1P10914 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF1P10914 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF1P10914 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF1P10914 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF1P10914 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF1P10914 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF1P10914 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF1P10914 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF1P10914 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF1P10914 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF1P10914 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF1P10914 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF1P10914 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF1P10914 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF1P10914 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF1P10914 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRF1P10914 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRF1P10914 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRF1P10914 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRF1P10914 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF1P10914 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF1P10914 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF1P10914 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF1P10914 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF1P10914 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF1P10914 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF1P10914 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF1P10914 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF1P10914 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF1P10914 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF1P10914 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF1P10914 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF1P10914 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF1P10914 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF1P10914 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF1P10914 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF1P10914 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF1P10914 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF1P10914 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF1P10914 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF1P10914 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF1P10914 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF1P10914 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF1P10914 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF1P10914 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF1P10914 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF1P10914 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF1P10914 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRF1P10914 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IRF1P10914 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF1P10914 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF1P10914 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF1P10914 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms