Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP10827 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP10827 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP10827 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP10827 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP10827 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP10827 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP10827 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP10827 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP10827 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THRAP10827 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP10827 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP10827 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP10827 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP10827 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP10827 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP10827 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP10827 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP10827 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP10827 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP10827 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP10827 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP10827 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP10827 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP10827 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP10827 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP10827 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP10827 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP10827 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP10827 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP10827 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP10827 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP10827 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP10827 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP10827 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP10827 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP10827 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP10827 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP10827 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP10827 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP10827 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP10827 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP10827 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP10827 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP10827 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP10827 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP10827 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP10827 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP10827 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP10827 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP10827 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP10827 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP10827 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP10827 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP10827 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP10827 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP10827 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP10827 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP10827 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP10827 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP10827 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP10827 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP10827 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP10827 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP10827 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP10827 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP10827 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP10827 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP10827 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP10827 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP10827 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP10827 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP10827 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP10827 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP10827 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP10827 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP10827 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP10827 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP10827 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP10827 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP10827 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP10827 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP10827 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP10827 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP10827 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP10827 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP10827 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP10827 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP10827 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP10827 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP10827 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP10827 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP10827 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP10827 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP10827 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP10827 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP10827 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP10827 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP10827 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP10827 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms