Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SRGAP2BP0DMP2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRGAP2BP0DMP2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2BP0DMP2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms