Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD7

PGA4, Pepsin A-4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA4P0DJD7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA4P0DJD7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PGA4P0DJD7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGA4P0DJD7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA4P0DJD7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA4P0DJD7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA4P0DJD7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA4P0DJD7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA4P0DJD7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA4P0DJD7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA4P0DJD7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms