Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD1P0DJD0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD1P0DJD0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
RGPD1P0DJD0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD1P0DJD0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms