Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC166P0CW27 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC166P0CW27 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC166P0CW27 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms