Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPSAP08865 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPSAP08865 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPSAP08865 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPSAP08865 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPSAP08865 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPSAP08865 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPSAP08865 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPSAP08865 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPSAP08865 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPSAP08865 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPSAP08865 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPSAP08865 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPSAP08865 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPSAP08865 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPSAP08865 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPSAP08865 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPSAP08865 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPSAP08865 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPSAP08865 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPSAP08865 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPSAP08865 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPSAP08865 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPSAP08865 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPSAP08865 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPSAP08865 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPSAP08865 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPSAP08865 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPSAP08865 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPSAP08865 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPSAP08865 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPSAP08865 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPSAP08865 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPSAP08865 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPSAP08865 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPSAP08865 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPSAP08865 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPSAP08865 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPSAP08865 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPSAP08865 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPSAP08865 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPSAP08865 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPSAP08865 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPSAP08865 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPSAP08865 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPSAP08865 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPSAP08865 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPSAP08865 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPSAP08865 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPSAP08865 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPSAP08865 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPSAP08865 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPSAP08865 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPSAP08865 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPSAP08865 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPSAP08865 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPSAP08865 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPSAP08865 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPSAP08865 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPSAP08865 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPSAP08865 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPSAP08865 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPSAP08865 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPSAP08865 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPSAP08865 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPSAP08865 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPSAP08865 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPSAP08865 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPSAP08865 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPSAP08865 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPSAP08865 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPSAP08865 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPSAP08865 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPSAP08865 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPSAP08865 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPSAP08865 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPSAP08865 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPSAP08865 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPSAP08865 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPSAP08865 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPSAP08865 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPSAP08865 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPSAP08865 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPSAP08865 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPSAP08865 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPSAP08865 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPSAP08865 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPSAP08865 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPSAP08865 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPSAP08865 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPSAP08865 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPSAP08865 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPSAP08865 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPSAP08865 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPSAP08865 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPSAP08865 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPSAP08865 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPSAP08865 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPSAP08865 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPSAP08865 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms