Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB1P08183 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB1P08183 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB1P08183 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB1P08183 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms