Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN1P07384 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN1P07384 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN1P07384 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN1P07384 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms