Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CSF1RP07333 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CSF1RP07333 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CSF1RP07333 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CSF1RP07333 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CSF1RP07333 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CSF1RP07333 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSF1RP07333 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CSF1RP07333 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CSF1RP07333 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms