Protein–RNA interactions for Protein: P07305

H1F0, Histone H1.0, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1F0P07305 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H1F0P07305 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H1F0P07305 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H1F0P07305 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H1F0P07305 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1F0P07305 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H1F0P07305 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H1F0P07305 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H1F0P07305 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H1F0P07305 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H1F0P07305 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H1F0P07305 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H1F0P07305 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H1F0P07305 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H1F0P07305 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1F0P07305 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1F0P07305 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1F0P07305 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1F0P07305 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1F0P07305 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1F0P07305 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1F0P07305 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1F0P07305 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1F0P07305 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1F0P07305 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H1F0P07305 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H1F0P07305 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H1F0P07305 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H1F0P07305 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H1F0P07305 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H1F0P07305 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H1F0P07305 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H1F0P07305 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H1F0P07305 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H1F0P07305 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H1F0P07305 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H1F0P07305 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H1F0P07305 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H1F0P07305 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H1F0P07305 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H1F0P07305 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H1F0P07305 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H1F0P07305 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H1F0P07305 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H1F0P07305 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H1F0P07305 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H1F0P07305 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H1F0P07305 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H1F0P07305 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H1F0P07305 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H1F0P07305 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H1F0P07305 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H1F0P07305 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H1F0P07305 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H1F0P07305 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H1F0P07305 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H1F0P07305 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H1F0P07305 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H1F0P07305 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H1F0P07305 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H1F0P07305 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H1F0P07305 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H1F0P07305 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H1F0P07305 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H1F0P07305 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H1F0P07305 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H1F0P07305 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H1F0P07305 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H1F0P07305 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H1F0P07305 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H1F0P07305 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H1F0P07305 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H1F0P07305 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H1F0P07305 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H1F0P07305 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H1F0P07305 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H1F0P07305 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H1F0P07305 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H1F0P07305 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H1F0P07305 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H1F0P07305 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H1F0P07305 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H1F0P07305 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H1F0P07305 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H1F0P07305 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H1F0P07305 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms