Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEFLP07196 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEFLP07196 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEFLP07196 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEFLP07196 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEFLP07196 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEFLP07196 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEFLP07196 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEFLP07196 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
NEFLP07196 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEFLP07196 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEFLP07196 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEFLP07196 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEFLP07196 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEFLP07196 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEFLP07196 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEFLP07196 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEFLP07196 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEFLP07196 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEFLP07196 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEFLP07196 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEFLP07196 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEFLP07196 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEFLP07196 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEFLP07196 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEFLP07196 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEFLP07196 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEFLP07196 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEFLP07196 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEFLP07196 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEFLP07196 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEFLP07196 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEFLP07196 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEFLP07196 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEFLP07196 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEFLP07196 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEFLP07196 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEFLP07196 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEFLP07196 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEFLP07196 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEFLP07196 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEFLP07196 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEFLP07196 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEFLP07196 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEFLP07196 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEFLP07196 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEFLP07196 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEFLP07196 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEFLP07196 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEFLP07196 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEFLP07196 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEFLP07196 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEFLP07196 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEFLP07196 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEFLP07196 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEFLP07196 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEFLP07196 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NEFLP07196 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEFLP07196 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEFLP07196 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEFLP07196 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEFLP07196 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEFLP07196 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEFLP07196 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEFLP07196 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEFLP07196 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEFLP07196 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFLP07196 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFLP07196 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFLP07196 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFLP07196 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFLP07196 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEFLP07196 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEFLP07196 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEFLP07196 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEFLP07196 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEFLP07196 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NEFLP07196 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEFLP07196 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEFLP07196 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEFLP07196 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEFLP07196 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEFLP07196 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEFLP07196 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEFLP07196 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEFLP07196 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEFLP07196 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEFLP07196 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFLP07196 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFLP07196 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFLP07196 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFLP07196 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFLP07196 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFLP07196 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFLP07196 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEFLP07196 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEFLP07196 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NEFLP07196 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEFLP07196 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEFLP07196 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 360.9 ms