Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB1P05556 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB1P05556 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms