Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TUBB4AP04350 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB4AP04350 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB4AP04350 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms