Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHBGP04278 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHBGP04278 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHBGP04278 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHBGP04278 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHBGP04278 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHBGP04278 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHBGP04278 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHBGP04278 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SHBGP04278 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHBGP04278 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHBGP04278 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SHBGP04278 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHBGP04278 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHBGP04278 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHBGP04278 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHBGP04278 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHBGP04278 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHBGP04278 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHBGP04278 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHBGP04278 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHBGP04278 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHBGP04278 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHBGP04278 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHBGP04278 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHBGP04278 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHBGP04278 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHBGP04278 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHBGP04278 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHBGP04278 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHBGP04278 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHBGP04278 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHBGP04278 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHBGP04278 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHBGP04278 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHBGP04278 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHBGP04278 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHBGP04278 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHBGP04278 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHBGP04278 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHBGP04278 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHBGP04278 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHBGP04278 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHBGP04278 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHBGP04278 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHBGP04278 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHBGP04278 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHBGP04278 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHBGP04278 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHBGP04278 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHBGP04278 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHBGP04278 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHBGP04278 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHBGP04278 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHBGP04278 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHBGP04278 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHBGP04278 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHBGP04278 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHBGP04278 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHBGP04278 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHBGP04278 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHBGP04278 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHBGP04278 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHBGP04278 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHBGP04278 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHBGP04278 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHBGP04278 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHBGP04278 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHBGP04278 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHBGP04278 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHBGP04278 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHBGP04278 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHBGP04278 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHBGP04278 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHBGP04278 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHBGP04278 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHBGP04278 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHBGP04278 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHBGP04278 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHBGP04278 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHBGP04278 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHBGP04278 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHBGP04278 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHBGP04278 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHBGP04278 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHBGP04278 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHBGP04278 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHBGP04278 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHBGP04278 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHBGP04278 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHBGP04278 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHBGP04278 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHBGP04278 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHBGP04278 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHBGP04278 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHBGP04278 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHBGP04278 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHBGP04278 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHBGP04278 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHBGP04278 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms