Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC3P02656 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC3P02656 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOC3P02656 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOC3P02656 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC3P02656 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC3P02656 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC3P02656 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC3P02656 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC3P02656 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC3P02656 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC3P02656 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC3P02656 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC3P02656 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC3P02656 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC3P02656 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC3P02656 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC3P02656 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC3P02656 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC3P02656 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC3P02656 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC3P02656 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC3P02656 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC3P02656 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC3P02656 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC3P02656 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC3P02656 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC3P02656 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC3P02656 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC3P02656 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC3P02656 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC3P02656 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC3P02656 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC3P02656 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC3P02656 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC3P02656 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC3P02656 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC3P02656 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC3P02656 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC3P02656 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC3P02656 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC3P02656 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC3P02656 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC3P02656 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC3P02656 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC3P02656 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC3P02656 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC3P02656 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC3P02656 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC3P02656 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC3P02656 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC3P02656 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC3P02656 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC3P02656 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC3P02656 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC3P02656 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC3P02656 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC3P02656 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC3P02656 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC3P02656 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC3P02656 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC3P02656 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC3P02656 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC3P02656 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC3P02656 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC3P02656 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC3P02656 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC3P02656 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC3P02656 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC3P02656 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC3P02656 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC3P02656 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC3P02656 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC3P02656 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC3P02656 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC3P02656 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC3P02656 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC3P02656 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC3P02656 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC3P02656 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC3P02656 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC3P02656 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC3P02656 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC3P02656 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC3P02656 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC3P02656 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC3P02656 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC3P02656 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC3P02656 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC3P02656 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC3P02656 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC3P02656 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC3P02656 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC3P02656 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC3P02656 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC3P02656 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC3P02656 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC3P02656 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC3P02656 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC3P02656 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms