Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA1P01009 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SERPINA1P01009 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms