Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
F2P00734 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
F2P00734 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
F2P00734 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
F2P00734 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
F2P00734 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F2P00734 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F2P00734 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
F2P00734 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F2P00734 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
F2P00734 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
F2P00734 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F2P00734 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F2P00734 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F2P00734 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F2P00734 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
F2P00734 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
F2P00734 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
F2P00734 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
F2P00734 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F2P00734 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
F2P00734 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F2P00734 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F2P00734 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F2P00734 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F2P00734 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
F2P00734 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
F2P00734 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F2P00734 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F2P00734 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F2P00734 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
F2P00734 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
F2P00734 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
F2P00734 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
F2P00734 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
F2P00734 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
F2P00734 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
F2P00734 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
F2P00734 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
F2P00734 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F2P00734 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F2P00734 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F2P00734 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
F2P00734 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F2P00734 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
F2P00734 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F2P00734 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
F2P00734 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
F2P00734 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
F2P00734 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.57■■■□□ 2
F2P00734 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
F2P00734 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
F2P00734 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
F2P00734 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
F2P00734 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
F2P00734 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
F2P00734 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
F2P00734 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
F2P00734 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
F2P00734 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
F2P00734 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
F2P00734 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
F2P00734 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
F2P00734 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.55■■■□□ 2
F2P00734 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
F2P00734 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
F2P00734 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
F2P00734 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
F2P00734 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
F2P00734 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
F2P00734 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
F2P00734 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
F2P00734 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
F2P00734 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
F2P00734 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
F2P00734 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
F2P00734 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
F2P00734 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
F2P00734 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
F2P00734 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
F2P00734 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
F2P00734 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
F2P00734 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
F2P00734 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
F2P00734 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
F2P00734 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
F2P00734 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
F2P00734 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
F2P00734 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
F2P00734 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
F2P00734 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
F2P00734 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
F2P00734 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
F2P00734 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
F2P00734 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
F2P00734 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
F2P00734 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
F2P00734 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
F2P00734 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
F2P00734 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms