Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX7O95931 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX7O95931 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX7O95931 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX7O95931 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX7O95931 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX7O95931 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX7O95931 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX7O95931 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX7O95931 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX7O95931 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX7O95931 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX7O95931 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX7O95931 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX7O95931 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX7O95931 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX7O95931 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX7O95931 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX7O95931 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX7O95931 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX7O95931 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX7O95931 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX7O95931 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX7O95931 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX7O95931 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX7O95931 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX7O95931 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX7O95931 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX7O95931 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX7O95931 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX7O95931 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX7O95931 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX7O95931 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX7O95931 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX7O95931 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX7O95931 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX7O95931 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX7O95931 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX7O95931 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX7O95931 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX7O95931 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX7O95931 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX7O95931 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX7O95931 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX7O95931 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX7O95931 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX7O95931 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX7O95931 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX7O95931 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX7O95931 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX7O95931 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX7O95931 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX7O95931 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX7O95931 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX7O95931 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX7O95931 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX7O95931 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX7O95931 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX7O95931 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX7O95931 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX7O95931 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX7O95931 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX7O95931 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX7O95931 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX7O95931 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX7O95931 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX7O95931 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX7O95931 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX7O95931 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX7O95931 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX7O95931 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX7O95931 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX7O95931 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX7O95931 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX7O95931 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX7O95931 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX7O95931 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX7O95931 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX7O95931 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX7O95931 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX7O95931 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX7O95931 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX7O95931 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX7O95931 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX7O95931 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX7O95931 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX7O95931 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX7O95931 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX7O95931 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX7O95931 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX7O95931 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX7O95931 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX7O95931 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX7O95931 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX7O95931 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX7O95931 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX7O95931 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX7O95931 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX7O95931 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX7O95931 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms