Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG7O95352 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG7O95352 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG7O95352 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATG7O95352 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG7O95352 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG7O95352 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG7O95352 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG7O95352 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG7O95352 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG7O95352 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG7O95352 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG7O95352 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG7O95352 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG7O95352 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG7O95352 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG7O95352 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG7O95352 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG7O95352 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG7O95352 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG7O95352 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG7O95352 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG7O95352 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG7O95352 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG7O95352 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG7O95352 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG7O95352 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG7O95352 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG7O95352 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG7O95352 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG7O95352 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG7O95352 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG7O95352 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG7O95352 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG7O95352 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG7O95352 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG7O95352 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG7O95352 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG7O95352 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG7O95352 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG7O95352 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG7O95352 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG7O95352 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG7O95352 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG7O95352 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG7O95352 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG7O95352 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG7O95352 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG7O95352 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG7O95352 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG7O95352 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG7O95352 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG7O95352 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG7O95352 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG7O95352 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG7O95352 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG7O95352 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG7O95352 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG7O95352 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG7O95352 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG7O95352 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG7O95352 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG7O95352 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG7O95352 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG7O95352 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATG7O95352 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG7O95352 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG7O95352 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG7O95352 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG7O95352 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG7O95352 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG7O95352 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG7O95352 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG7O95352 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG7O95352 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG7O95352 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG7O95352 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG7O95352 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG7O95352 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG7O95352 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG7O95352 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG7O95352 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG7O95352 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG7O95352 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG7O95352 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG7O95352 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG7O95352 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG7O95352 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG7O95352 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG7O95352 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG7O95352 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG7O95352 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG7O95352 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG7O95352 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG7O95352 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG7O95352 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG7O95352 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG7O95352 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG7O95352 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG7O95352 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms