Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM13AO94988 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM13AO94988 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM13AO94988 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms