Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRP72O76094 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRP72O76094 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRP72O76094 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRP72O76094 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRP72O76094 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRP72O76094 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRP72O76094 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRP72O76094 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRP72O76094 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRP72O76094 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRP72O76094 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP72O76094 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP72O76094 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP72O76094 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP72O76094 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP72O76094 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP72O76094 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP72O76094 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP72O76094 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP72O76094 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP72O76094 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP72O76094 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP72O76094 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP72O76094 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP72O76094 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP72O76094 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP72O76094 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP72O76094 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP72O76094 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP72O76094 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP72O76094 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP72O76094 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP72O76094 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP72O76094 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP72O76094 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP72O76094 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP72O76094 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP72O76094 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP72O76094 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP72O76094 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP72O76094 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP72O76094 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP72O76094 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP72O76094 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP72O76094 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP72O76094 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP72O76094 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP72O76094 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP72O76094 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP72O76094 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP72O76094 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP72O76094 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP72O76094 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP72O76094 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP72O76094 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP72O76094 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP72O76094 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP72O76094 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP72O76094 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP72O76094 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRP72O76094 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP72O76094 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP72O76094 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP72O76094 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP72O76094 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP72O76094 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP72O76094 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP72O76094 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP72O76094 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP72O76094 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP72O76094 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP72O76094 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP72O76094 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP72O76094 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP72O76094 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP72O76094 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP72O76094 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP72O76094 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP72O76094 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP72O76094 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP72O76094 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP72O76094 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRP72O76094 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRP72O76094 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRP72O76094 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRP72O76094 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRP72O76094 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms