Protein–RNA interactions for Protein: O75631

UPK3A, Uroplakin-3a, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3AO75631 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3AO75631 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3AO75631 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3AO75631 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3AO75631 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3AO75631 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3AO75631 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3AO75631 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3AO75631 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3AO75631 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3AO75631 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPK3AO75631 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPK3AO75631 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPK3AO75631 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3AO75631 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3AO75631 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3AO75631 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3AO75631 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3AO75631 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3AO75631 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3AO75631 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3AO75631 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3AO75631 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3AO75631 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms