Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM3O75607 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM3O75607 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM3O75607 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM3O75607 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM3O75607 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM3O75607 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM3O75607 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM3O75607 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPM3O75607 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPM3O75607 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPM3O75607 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPM3O75607 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPM3O75607 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPM3O75607 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPM3O75607 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM3O75607 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM3O75607 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM3O75607 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM3O75607 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM3O75607 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM3O75607 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM3O75607 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM3O75607 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM3O75607 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM3O75607 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM3O75607 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NPM3O75607 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NPM3O75607 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPM3O75607 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPM3O75607 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM3O75607 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM3O75607 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM3O75607 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM3O75607 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM3O75607 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM3O75607 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM3O75607 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM3O75607 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPM3O75607 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPM3O75607 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPM3O75607 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM3O75607 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM3O75607 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM3O75607 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM3O75607 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NPM3O75607 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NPM3O75607 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM3O75607 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM3O75607 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM3O75607 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM3O75607 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM3O75607 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM3O75607 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM3O75607 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM3O75607 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM3O75607 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM3O75607 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM3O75607 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM3O75607 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM3O75607 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM3O75607 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM3O75607 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM3O75607 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPM3O75607 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPM3O75607 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM3O75607 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM3O75607 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM3O75607 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM3O75607 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM3O75607 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM3O75607 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM3O75607 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPM3O75607 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPM3O75607 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPM3O75607 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NPM3O75607 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPM3O75607 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPM3O75607 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPM3O75607 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPM3O75607 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPM3O75607 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPM3O75607 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPM3O75607 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM3O75607 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM3O75607 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM3O75607 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM3O75607 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM3O75607 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM3O75607 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPM3O75607 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPM3O75607 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPM3O75607 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPM3O75607 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM3O75607 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM3O75607 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM3O75607 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPM3O75607 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM3O75607 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM3O75607 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms