Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4BP1O75113 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP1O75113 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms