Protein–RNA interactions for Protein: O60645

EXOC3, Exocyst complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOC3O60645 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOC3O60645 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOC3O60645 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOC3O60645 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOC3O60645 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOC3O60645 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOC3O60645 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOC3O60645 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOC3O60645 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOC3O60645 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOC3O60645 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOC3O60645 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EXOC3O60645 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOC3O60645 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms