Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLOD3O60568 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD3O60568 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms