Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOBOXO60393 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOBOXO60393 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOBOXO60393 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms