Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MARCH6O60337 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARCH6O60337 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MARCH6O60337 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms