Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP104O60308 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP104O60308 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP104O60308 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP104O60308 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP104O60308 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP104O60308 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP104O60308 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP104O60308 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP104O60308 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP104O60308 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP104O60308 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP104O60308 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP104O60308 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP104O60308 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP104O60308 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP104O60308 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP104O60308 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP104O60308 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP104O60308 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP104O60308 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP104O60308 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP104O60308 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP104O60308 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP104O60308 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP104O60308 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP104O60308 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP104O60308 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP104O60308 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP104O60308 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP104O60308 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP104O60308 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP104O60308 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEP104O60308 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEP104O60308 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEP104O60308 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEP104O60308 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEP104O60308 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP104O60308 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP104O60308 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP104O60308 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP104O60308 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP104O60308 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP104O60308 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP104O60308 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP104O60308 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP104O60308 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP104O60308 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP104O60308 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP104O60308 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP104O60308 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP104O60308 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP104O60308 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP104O60308 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP104O60308 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP104O60308 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP104O60308 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP104O60308 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP104O60308 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP104O60308 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP104O60308 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP104O60308 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP104O60308 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP104O60308 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP104O60308 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP104O60308 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP104O60308 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP104O60308 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP104O60308 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP104O60308 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP104O60308 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP104O60308 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP104O60308 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP104O60308 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP104O60308 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP104O60308 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP104O60308 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP104O60308 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP104O60308 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP104O60308 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP104O60308 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP104O60308 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP104O60308 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP104O60308 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP104O60308 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP104O60308 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP104O60308 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP104O60308 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP104O60308 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP104O60308 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP104O60308 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP104O60308 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP104O60308 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP104O60308 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP104O60308 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP104O60308 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP104O60308 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP104O60308 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP104O60308 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP104O60308 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms