Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms