Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3O43889 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3O43889 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3O43889 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3O43889 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CREB3O43889 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3O43889 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3O43889 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3O43889 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3O43889 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3O43889 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3O43889 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3O43889 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3O43889 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3O43889 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3O43889 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3O43889 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3O43889 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3O43889 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3O43889 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREB3O43889 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREB3O43889 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREB3O43889 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREB3O43889 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREB3O43889 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3O43889 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3O43889 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3O43889 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3O43889 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3O43889 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3O43889 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3O43889 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB3O43889 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB3O43889 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB3O43889 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB3O43889 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB3O43889 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CREB3O43889 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3O43889 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3O43889 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3O43889 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3O43889 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3O43889 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3O43889 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3O43889 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3O43889 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3O43889 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3O43889 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3O43889 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3O43889 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3O43889 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB3O43889 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3O43889 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3O43889 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3O43889 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3O43889 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3O43889 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3O43889 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3O43889 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3O43889 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB3O43889 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB3O43889 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB3O43889 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB3O43889 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB3O43889 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3O43889 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3O43889 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3O43889 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3O43889 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3O43889 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB3O43889 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CREB3O43889 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3O43889 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3O43889 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB3O43889 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3O43889 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3O43889 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3O43889 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3O43889 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB3O43889 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CREB3O43889 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CREB3O43889 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3O43889 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3O43889 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3O43889 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3O43889 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3O43889 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB3O43889 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms