Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COCHO43405 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COCHO43405 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COCHO43405 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
COCHO43405 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COCHO43405 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COCHO43405 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COCHO43405 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COCHO43405 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COCHO43405 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COCHO43405 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COCHO43405 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COCHO43405 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COCHO43405 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COCHO43405 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COCHO43405 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COCHO43405 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COCHO43405 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COCHO43405 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COCHO43405 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COCHO43405 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COCHO43405 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COCHO43405 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COCHO43405 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
COCHO43405 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COCHO43405 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COCHO43405 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COCHO43405 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COCHO43405 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COCHO43405 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COCHO43405 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COCHO43405 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COCHO43405 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COCHO43405 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COCHO43405 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COCHO43405 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COCHO43405 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COCHO43405 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COCHO43405 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
COCHO43405 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COCHO43405 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COCHO43405 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COCHO43405 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COCHO43405 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COCHO43405 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COCHO43405 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COCHO43405 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COCHO43405 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COCHO43405 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COCHO43405 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COCHO43405 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COCHO43405 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COCHO43405 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COCHO43405 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COCHO43405 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COCHO43405 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COCHO43405 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COCHO43405 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COCHO43405 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COCHO43405 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COCHO43405 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COCHO43405 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COCHO43405 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COCHO43405 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COCHO43405 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COCHO43405 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COCHO43405 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COCHO43405 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COCHO43405 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COCHO43405 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COCHO43405 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COCHO43405 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COCHO43405 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COCHO43405 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COCHO43405 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COCHO43405 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COCHO43405 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COCHO43405 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COCHO43405 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COCHO43405 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COCHO43405 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COCHO43405 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COCHO43405 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COCHO43405 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COCHO43405 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COCHO43405 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COCHO43405 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COCHO43405 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COCHO43405 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COCHO43405 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COCHO43405 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COCHO43405 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COCHO43405 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COCHO43405 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COCHO43405 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COCHO43405 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COCHO43405 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COCHO43405 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COCHO43405 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COCHO43405 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms