Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOXA2O43364 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXA2O43364 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA2O43364 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms