Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTIFO43310 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CTIFO43310 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTIFO43310 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTIFO43310 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTIFO43310 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTIFO43310 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTIFO43310 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTIFO43310 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTIFO43310 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTIFO43310 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTIFO43310 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CTIFO43310 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTIFO43310 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTIFO43310 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTIFO43310 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTIFO43310 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTIFO43310 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTIFO43310 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTIFO43310 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTIFO43310 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTIFO43310 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTIFO43310 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTIFO43310 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTIFO43310 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTIFO43310 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTIFO43310 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTIFO43310 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTIFO43310 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTIFO43310 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTIFO43310 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTIFO43310 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTIFO43310 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTIFO43310 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTIFO43310 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CTIFO43310 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTIFO43310 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTIFO43310 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTIFO43310 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTIFO43310 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTIFO43310 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTIFO43310 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTIFO43310 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTIFO43310 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTIFO43310 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTIFO43310 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTIFO43310 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTIFO43310 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTIFO43310 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CTIFO43310 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTIFO43310 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTIFO43310 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTIFO43310 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTIFO43310 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTIFO43310 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTIFO43310 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTIFO43310 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTIFO43310 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTIFO43310 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTIFO43310 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTIFO43310 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTIFO43310 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CTIFO43310 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTIFO43310 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTIFO43310 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTIFO43310 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTIFO43310 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTIFO43310 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTIFO43310 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTIFO43310 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTIFO43310 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTIFO43310 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTIFO43310 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTIFO43310 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTIFO43310 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTIFO43310 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTIFO43310 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CTIFO43310 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTIFO43310 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTIFO43310 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTIFO43310 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTIFO43310 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTIFO43310 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTIFO43310 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTIFO43310 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTIFO43310 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTIFO43310 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTIFO43310 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTIFO43310 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTIFO43310 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTIFO43310 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTIFO43310 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTIFO43310 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTIFO43310 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTIFO43310 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTIFO43310 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTIFO43310 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTIFO43310 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTIFO43310 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTIFO43310 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
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