Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 41.8
RBFOX2O43251 EDC4-208ENST00000574770 1425 ntTSL 511.86□□□□□ -0.511e-11■■■■■ 41.8
RBFOX2O43251 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.642e-11■■■■■ 41.8
RBFOX2O43251 STAG3L1-201ENST00000404291 496 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.412e-11■■■■■ 41.8
RBFOX2O43251 AL596202.1-201ENST00000435295 3088 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.999e-11■■■■■ 41.7
RBFOX2O43251 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.244e-10■■■■■ 41.7
RBFOX2O43251 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.314e-10■■■■■ 41.7
RBFOX2O43251 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.334e-10■■■■■ 41.7
RBFOX2O43251 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.44e-10■■■■■ 41.7
RBFOX2O43251 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-11■■■■■ 41.7
RBFOX2O43251 ADGRD1-203ENST00000376682 4135 ntTSL 29.77□□□□□ -0.853e-11■■■■■ 41.7
RBFOX2O43251 ADGRD1-205ENST00000535015 2776 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.093e-11■■■■■ 41.7
RBFOX2O43251 SLC27A5-205ENST00000595851 2003 ntTSL 215.07■□□□□ 06e-11■■■■■ 41.6
RBFOX2O43251 ZNF331-219ENST00000513929 1424 ntTSL 214.59□□□□□ -0.078e-12■■■■■ 41.6
RBFOX2O43251 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.17□□□□□ -0.38e-12■■■■■ 41.6
RBFOX2O43251 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.688e-12■■■■■ 41.6
RBFOX2O43251 FAM102A-201ENST00000300434 3148 ntTSL 1 (best)12.17□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 41.6
RBFOX2O43251 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 41.6
RBFOX2O43251 FAM102A-204ENST00000465821 4316 ntTSL 29.84□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 41.6
RBFOX2O43251 ASPSCR1-203ENST00000344865 1041 ntTSL 216.63■□□□□ 0.259e-9■■■■■ 41.5
RBFOX2O43251 ASPSCR1-209ENST00000581484 1001 ntTSL 213.1□□□□□ -0.319e-9■■■■■ 41.5
RBFOX2O43251 HCG18-242ENST00000602319 3342 ntBASIC8.34□□□□□ -1.077e-12■■■■■ 41.5
RBFOX2O43251 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 41.4
RBFOX2O43251 MAP3K11-202ENST00000524848 2139 ntTSL 216.2■□□□□ 0.183e-12■■■■■ 41.4
RBFOX2O43251 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.23e-12■■■■■ 41.4
RBFOX2O43251 MAP3K11-203ENST00000524856 3787 ntTSL 212.99□□□□□ -0.333e-12■■■■■ 41.4
RBFOX2O43251 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.443e-12■■■■■ 41.4
RBFOX2O43251 TTC6-205ENST00000533625 3567 ntTSL 213.07□□□□□ -0.327e-7■■■■■ 41.3
RBFOX2O43251 DMKN-261ENST00000498593 609 ntTSL 214.43□□□□□ -0.14e-12■■■■■ 41.2
RBFOX2O43251 DMKN-235ENST00000471786 751 ntTSL 314.07□□□□□ -0.164e-12■■■■■ 41.2
RBFOX2O43251 DMKN-249ENST00000486450 583 ntTSL 312.56□□□□□ -0.44e-12■■■■■ 41.2
RBFOX2O43251 DMKN-246ENST00000482321 866 ntTSL 210.56□□□□□ -0.724e-12■■■■■ 41.2
RBFOX2O43251 DMKN-227ENST00000466587 325 ntTSL 59.04□□□□□ -0.964e-12■■■■■ 41.2
RBFOX2O43251 DMKN-242ENST00000476246 712 ntTSL 38.67□□□□□ -1.024e-12■■■■■ 41.2
RBFOX2O43251 WDR27-205ENST00000467418 947 ntTSL 58.15□□□□□ -1.14e-12■■■■■ 41.2
RBFOX2O43251 DMKN-234ENST00000471017 410 ntTSL 26.24□□□□□ -1.414e-12■■■■■ 41.2
RBFOX2O43251 DMKN-267ENST00000602679 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 36.24□□□□□ -1.414e-12■■■■■ 41.2
RBFOX2O43251 DMKN-260ENST00000498269 402 ntTSL 35.22□□□□□ -1.574e-12■■■■■ 41.2
RBFOX2O43251 HDAC4-209ENST00000487617 819 ntTSL 315.72■□□□□ 0.118e-12■■■■■ 41.1
RBFOX2O43251 ARID1B-225ENST00000637532 445 ntTSL 59.03□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 41.1
RBFOX2O43251 ARID1B-213ENST00000636205 824 ntTSL 25.44□□□□□ -1.546e-7■■■■■ 41.1
RBFOX2O43251 PDE8A-211ENST00000559742 2584 ntTSL 1 (best)15.56■□□□□ 0.088e-12■■■■■ 41
RBFOX2O43251 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.048e-12■■■■■ 41
RBFOX2O43251 PDE8A-204ENST00000478717 2722 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.028e-12■■■■■ 41
RBFOX2O43251 PDE8A-205ENST00000485596 2999 ntTSL 1 (best)14.37□□□□□ -0.118e-12■■■■■ 41
RBFOX2O43251 PDE8A-210ENST00000559086 538 ntTSL 413.12□□□□□ -0.318e-12■■■■■ 41
RBFOX2O43251 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.498e-12■■■■■ 41
RBFOX2O43251 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.58e-12■■■■■ 41
RBFOX2O43251 PDE8A-208ENST00000557957 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.888e-12■■■■■ 41
RBFOX2O43251 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.621e-11■■■■■ 40.9
RBFOX2O43251 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.611e-11■■■■■ 40.9
RBFOX2O43251 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.521e-11■■■■■ 40.9
RBFOX2O43251 MAGI2-216ENST00000628997 641 ntTSL 310.26□□□□□ -0.771e-11■■■■■ 40.9
RBFOX2O43251 MAGI2-236ENST00000637441 5822 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.031e-11■■■■■ 40.9
RBFOX2O43251 MAGI2-226ENST00000636424 102 ntTSL 50.61□□□□□ -2.311e-11■■■■■ 40.9
RBFOX2O43251 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 40.9
RBFOX2O43251 AMDHD2-217ENST00000569879 924 ntTSL 314.62□□□□□ -0.079e-11■■■■■ 40.8
RBFOX2O43251 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 40.8
RBFOX2O43251 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 40.8
RBFOX2O43251 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 40.8
RBFOX2O43251 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 40.8
RBFOX2O43251 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 PHPT1-205ENST00000492540 1316 ntTSL 1 (best)14.44□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 PKD1P6-206ENST00000546358 579 ntTSL 312.88□□□□□ -0.353e-39■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 PKD1P6-204ENST00000540075 656 ntTSL 212.08□□□□□ -0.483e-39■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 MAP3K7-204ENST00000369329 4911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.911e-8■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 MAP3K7-205ENST00000369332 4830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -12e-7■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 CCDC88A-203ENST00000412148 2880 ntTSL 1 (best)4.82□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.671e-8■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.691e-8■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.931e-8■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 CCDC88A-205ENST00000426576 4500 ntTSL 1 (best)2.07□□□□□ -2.082e-7■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 CCDC88A-208ENST00000444458 4236 ntTSL 21.67□□□□□ -2.142e-7■■■■■ 40.6
RBFOX2O43251 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.614e-9■■■■■ 40.4
RBFOX2O43251 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.224e-9■■■■■ 40.4
RBFOX2O43251 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.314e-9■■■■■ 40.4
RBFOX2O43251 TRIP10-212ENST00000600677 2022 ntTSL 512.81□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 40.4
RBFOX2O43251 TRIP10-203ENST00000595305 2068 ntTSL 212.74□□□□□ -0.374e-9■■■■■ 40.4
RBFOX2O43251 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.424e-9■■■■■ 40.4
RBFOX2O43251 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 40.4
RBFOX2O43251 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 40.3
RBFOX2O43251 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.496e-7■■■■■ 40.3
RBFOX2O43251 ARF4-204ENST00000486310 1601 ntTSL 35.72□□□□□ -1.496e-7■■■■■ 40.3
RBFOX2O43251 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.946e-7■■■■■ 40.3
RBFOX2O43251 TRIP10-209ENST00000598843 469 ntTSL 210.28□□□□□ -0.763e-16■■■■■ 40.3
RBFOX2O43251 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.063e-8■■■■■ 40.2
RBFOX2O43251 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.043e-8■■■■■ 40.2
RBFOX2O43251 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 40.2
RBFOX2O43251 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 40.2
RBFOX2O43251 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 40.2
RBFOX2O43251 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.24e-12■■■■■ 40.2
RBFOX2O43251 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.064e-12■■■■■ 40.2
RBFOX2O43251 RAC1-204ENST00000488373 845 ntTSL 1 (best)13.72□□□□□ -0.214e-12■■■■■ 40.2
RBFOX2O43251 RAC1-206ENST00000497741 651 ntTSL 27.08□□□□□ -1.284e-12■■■■■ 40.2
RBFOX2O43251 TTC7A-209ENST00000484061 3085 ntTSL 1 (best)12.17□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 40.1
RBFOX2O43251 TTC7A-205ENST00000440051 641 ntTSL 511.68□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 40.1
Retrieved 100 of 22,255 protein–RNA pairs in 108.9 ms