Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM9SF1O15321 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF1O15321 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM9SF1O15321 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF1O15321 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms