Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
O00370 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
O00370 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
O00370 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
O00370 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
O00370 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
O00370 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
O00370 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
O00370 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
O00370 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
O00370 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
O00370 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
O00370 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
O00370 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
O00370 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
O00370 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
O00370 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
O00370 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
O00370 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
O00370 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
O00370 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
O00370 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
O00370 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
O00370 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
O00370 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
O00370 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
O00370 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
O00370 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
O00370 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
O00370 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
O00370 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
O00370 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
O00370 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
O00370 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
O00370 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
O00370 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
O00370 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
O00370 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
O00370 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
O00370 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
O00370 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
O00370 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
O00370 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
O00370 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
O00370 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
O00370 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
O00370 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
O00370 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
O00370 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
O00370 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
O00370 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
O00370 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
O00370 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
O00370 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
O00370 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
O00370 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
O00370 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
O00370 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
O00370 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
O00370 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
O00370 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
O00370 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
O00370 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
O00370 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
O00370 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
O00370 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
O00370 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
O00370 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
O00370 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
O00370 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
O00370 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
O00370 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
O00370 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
O00370 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
O00370 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
O00370 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
O00370 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
O00370 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
O00370 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
O00370 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
O00370 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
O00370 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
O00370 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
O00370 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
O00370 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
O00370 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
O00370 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
O00370 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
O00370 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
O00370 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
O00370 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
O00370 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
O00370 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
O00370 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
O00370 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
O00370 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
O00370 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
O00370 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
O00370 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
O00370 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms