Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms