Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QW42 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
J3QW42 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QW42 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QW42 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QW42 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QW42 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QW42 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.32■■□□□ 1
J3QW42 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QW42 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QW42 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QW42 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QW42 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QW42 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QW42 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QW42 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QW42 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QW42 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QW42 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
J3QW42 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
J3QW42 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QW42 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
J3QW42 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QW42 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QW42 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QW42 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QW42 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QW42 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QW42 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
J3QW42 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QW42 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QW42 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QW42 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QW42 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QW42 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QW42 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QW42 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QW42 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QW42 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QW42 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QW42 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QW42 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QW42 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QW42 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QW42 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QW42 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QW42 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QW42 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QW42 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QW42 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QW42 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QW42 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QW42 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QW42 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QW42 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QW42 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QW42 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QW42 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QW42 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QW42 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QW42 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QW42 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QW42 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QW42 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QW42 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QW42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
J3QW42 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QW42 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QW42 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QW42 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QW42 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QW42 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QW42 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QW42 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QW42 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QW42 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QW42 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QW42 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QW42 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QW42 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QW42 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QW42 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QW42 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QW42 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QW42 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QW42 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QW42 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QW42 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QW42 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QW42 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QW42 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QW42 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QW42 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QW42 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QW42 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QW42 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QW42 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QW42 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QW42 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QW42 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms