Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMKR1H3BMG3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMKR1H3BMG3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMKR1H3BMG3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMKR1H3BMG3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMKR1H3BMG3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMKR1H3BMG3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMKR1H3BMG3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMKR1H3BMG3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMKR1H3BMG3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMKR1H3BMG3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMKR1H3BMG3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms