Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP17L11C9JVI0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L11C9JVI0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L11C9JVI0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L11C9JVI0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L11C9JVI0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms