Protein–RNA interactions for Protein: C9J798

RASA4B, Ras GTPase-activating protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4BC9J798 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RASA4BC9J798 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASA4BC9J798 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASA4BC9J798 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASA4BC9J798 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms