Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM114B3SHH9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM114B3SHH9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM114B3SHH9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM114B3SHH9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM114B3SHH9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms