Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00587B1AMM8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00587B1AMM8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms