Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCE1LA8MT33 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCE1LA8MT33 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms