Protein–RNA interactions for Protein: A7E2F4

GOLGA8A, Golgin subfamily A member 8A, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8AA7E2F4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA8AA7E2F4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA8AA7E2F4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA8AA7E2F4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA8AA7E2F4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA8AA7E2F4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA8AA7E2F4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA8AA7E2F4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA8AA7E2F4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA8AA7E2F4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA8AA7E2F4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GOLGA8AA7E2F4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GOLGA8AA7E2F4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA8AA7E2F4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA8AA7E2F4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA8AA7E2F4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA8AA7E2F4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA8AA7E2F4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA8AA7E2F4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA8AA7E2F4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA8AA7E2F4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA8AA7E2F4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA8AA7E2F4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA8AA7E2F4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA8AA7E2F4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms